MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017799	AGTAT	2	10	123	132	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017799	ACTA	2	8	146	153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017799	TA	3	6	152	157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017799	ATA	2	6	199	204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858624
5	NC_017799	A	9	9	210	218	100 %	0 %	0 %	0 %	386858624
6	NC_017799	A	6	6	230	235	100 %	0 %	0 %	0 %	386858624
7	NC_017799	TGTT	2	8	242	249	0 %	75 %	25 %	0 %	386858624
8	NC_017799	TAA	2	6	307	312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858624
9	NC_017799	AT	3	6	340	345	50 %	50 %	0 %	0 %	386858624
10	NC_017799	ATT	3	9	407	415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858624
11	NC_017799	AAGA	2	8	473	480	75 %	0 %	25 %	0 %	386858624
12	NC_017799	A	6	6	511	516	100 %	0 %	0 %	0 %	386858624
13	NC_017799	CAA	2	6	627	632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858624
14	NC_017799	A	7	7	646	652	100 %	0 %	0 %	0 %	386858624
15	NC_017799	ATG	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858624
16	NC_017799	AAAC	2	8	758	765	75 %	0 %	0 %	25 %	386858624
17	NC_017799	GAAA	2	8	812	819	75 %	0 %	25 %	0 %	386858624
18	NC_017799	A	7	7	859	865	100 %	0 %	0 %	0 %	386858624
19	NC_017799	GAT	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858624
20	NC_017799	TTG	2	6	912	917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858624
21	NC_017799	ACA	2	6	921	926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858624
22	NC_017799	TTA	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858624
23	NC_017799	AT	3	6	1051	1056	50 %	50 %	0 %	0 %	386858624
24	NC_017799	ATA	2	6	1077	1082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858624
25	NC_017799	ATT	2	6	1115	1120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858624
26	NC_017799	A	6	6	1139	1144	100 %	0 %	0 %	0 %	386858624
27	NC_017799	CAA	2	6	1191	1196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858624
28	NC_017799	A	6	6	1221	1226	100 %	0 %	0 %	0 %	386858624
29	NC_017799	A	6	6	1233	1238	100 %	0 %	0 %	0 %	386858624
30	NC_017799	ATG	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858624
31	NC_017799	ACT	2	6	1253	1258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858624
32	NC_017799	TAA	2	6	1372	1377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858624
33	NC_017799	ATC	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858624
34	NC_017799	ATT	2	6	1437	1442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017799	A	7	7	1454	1460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017799	CAA	3	9	1470	1478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017799	ATA	2	6	1518	1523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017799	A	8	8	1567	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017799	TTG	2	6	1592	1597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017799	T	8	8	1604	1611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017799	CT	3	6	1647	1652	0 %	50 %	0 %	50 %	386858625
42	NC_017799	ATT	2	6	1706	1711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858625
43	NC_017799	TTA	2	6	1728	1733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858625
44	NC_017799	CTTC	2	8	1734	1741	0 %	50 %	0 %	50 %	386858625
45	NC_017799	T	6	6	1744	1749	0 %	100 %	0 %	0 %	386858625
46	NC_017799	TCT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858625
47	NC_017799	GAT	2	6	1772	1777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858625
48	NC_017799	TAA	2	6	1858	1863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858625
49	NC_017799	TTG	2	6	1891	1896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858625
50	NC_017799	TCT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858625
51	NC_017799	CTG	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858625
52	NC_017799	CAT	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858625
53	NC_017799	TCTGCC	2	12	2058	2069	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386858625

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.